慶余年太平別院的秘密是湖底的禁忌之門。根據(jù)葉輕眉在信中提到的內(nèi)容,這扇門可能是一個(gè)實(shí)驗(yàn)室,里面可能有現(xiàn)代化的高科技設(shè)備,如手機(jī)、導(dǎo)航、電腦等。這個(gè)秘密涉及到范閑的身世和命運(yùn),以及葉輕眉的實(shí)驗(yàn)和種子的真相。具體來說,湖底的秘密可能與范閑的母親死因有關(guān),范閑可能通過揭開母親死因的真相來與慶帝決一死戰(zhàn)。然而,關(guān)于具體的秘密內(nèi)容,搜索結(jié)果中并沒有提供明確的答案。